《弹丸论破3》是一款由Spike Chunsoft制作的冒险类游戏，本作分为“绝望篇”和“希望篇”两个部分，分别描述着“最绝望的故事 finale”以及“逆转的未来”两个不同的故事。本文将聚焦于“绝望篇”部分。
本作的故事则发生在《弹丸论破2》的两年后，男主角苗木诚和女主角琉璃心在一次神秘的招待会上意外的失去了意识，醒来后却发现自己和其他14名高中生被关在一所高中内部。更为奇怪的是，这所高中却是全球最顶尖的奖学金制度的学校——希望之峰学园。而此时，他们的主持人就是之前的系列作的高桥久嗣。
这所学园之所以被称作“绝望之峰”，是因为这里集合了全世界最出色的高中生，尽管这是一件应该被庆幸的事情，但是学校却成为腥风血雨的地方——因为在这里，只有“胜利者”才能毕业。
在这个入学考试就非常恐怖的学校内，苗木诚和其他14名学生们将会被迫参加种种“任务”——被称为“绝望博士——安卓真理田”的科学家所提出的一系列毁天灭地的任务——他们必须接受各种变态的试验，他们的过去也会逐渐被揭开。